Kazuki Mutou, siswa SMU kelas 2, mengalami mimpi aneh yang penuh kesakitan dan ketakutan. Ternyata mimpi itu nyata dan merupakan awal dari takdirnya menjadi seorang pembasmi monster yang berwujud manusia dan pemakan manusia bernama Homunculus.
Yang pertama menjadi lawannya adalah Pak Mita, gurunya di sekolah yang tiba-tiba berubah sikapnya jadi aneh.